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Caratterizzazione Genetica

SUIS - SUIS.2
Marcatore Capi Alleli Genotipi
  N. Q WT QQ QWT WTWT
VRTN 1233 53,24% 46,76% 31,14% 44,20% 24,66%
  N. C G CC CG GG
MUC4 249 58,00% 42,00% 34,70% 47,70% 17,60%
  N. G A GG GA AA
IGF2 523 12,00% 88,00% 3,00% 19,00% 78,00%
  N. A G AA AG GG
WUR10000125 (PRRS) 9783 95,50% 4,50% 91,00% 9,00% 0,00%
  N. A G AA AG GG
Marker Metabolico (RESILIENZA) 9789 21,50% 78,50% 5,00% 33,00% 62,00%
  N. A G AA AG GG
Marker 1 (BENESSERE) 9613 78,71% 21,29% 62,64% 32,15% 4,85%
  N. A C AA AC CC
Marker 2 (BENESSERE) 9798 55,50% 44,50% 31,00% 49,00% 20,00%
  N. A G AA AG GG
Marker 3 (BENESSERE) 9715 40,50% 59,50% 17,00% 47,00% 36,00%
  N. A G AA AG GG
Marker enteriti (ENTERITI) 9808 50,00% 50,00% 25,25% 49,50% 25,25%

Legenda:

  • WUR associato alla resistenza alla PRRS. Allele favorevole G
  • Marc. Metabolic. associato a funzioni metaboliche che determinano la resistenza/resilienza. Allele favorevole G
  • Marker 1 associato a funzioni metaboliche che condizionano comportamento e benessere. Allele favorevole A
  • Marker 2 associato a funzioni metaboliche che condizionano comportamento e benessere. Allele favorevole A
  • Marker 3 associato a funzioni metaboliche che condizionano comportamento e benessere. Allele favorevole G
  • Marker enteriti associato alla resistenza neonatale a Escherichia Coli Enterotossici (ETEC). Allele favorevole G
  • VRTN (Vertnin) associato al numero di vertebre e mammelle. Allele favorevole Q

INBREEDING GENOMICO

Capi FROH ROH N. ROH (kb) Lunghezza
N. Media Media d.s. Min Max Media d.s. Min Max
9539 0,152 59,891 11,574 4 137 6167,57 4338,75 1000,02 236089,00

Legenda:

  • Consanguineità genomica stimata individuando regioni genomiche omozigoti, dette Runs Homozygosity (ROH). Il coefficiente di consanguineità genomico, FROH, si basa sulla percentuale del genoma autosomico di ROH in un animale (somma ROH>1000 kb). Gli animali sono stati genotipizzati con pannello SNPChip 70 K.