Duroc Italiana
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Caratterizzazione Genetica
| Marcatore | Capi | Alleli | Genotipi | |||
|---|---|---|---|---|---|---|
| N. | Q | WT | QWT | WTWT | ||
| VRTN | 1079 | 42,1% | 57,9% | 21,7% | 40,9% | 37,4% |
| N. | C | T | CC | CT | TT | |
| KIT C>T | 392 | 100,0% | 0,0% | 100,0% | 0,0% | 0,0% |
| N. | e | E+ | e/e | E+/e | ED2/e | |
| MC1R | 30 | 100,0% | 0,0% | 100,0% | 0,0% | 0,0% |
| N. | A | G | AA | AG | GG | |
| WUR10000125 (PRRS) | 937 | 77,0% | 23,0% | 60,0% | 35,0% | 5,0% |
| N. | A | G | AA | AG | GG | |
| Marker Metabolico (RESILIENZA) | 936 | 13,0% | 87,0% | 1,0% | 24,0% | 75,0% |
| N. | A | G | AA | AG | GG | |
| Marker 1 (BENESSERE) | 937 | 15,0% | 85,0% | 2,0% | 27,0% | 71,0% |
| N. | A | C | AA | AC | CC | |
| Marker 2 (BENESSERE) | 936 | 72,0% | 28,0% | 51,0% | 42,0% | 7,0% |
| N. | A | G | AA | AG | GG | |
| Marker 3 (BENESSERE) | 937 | 28,0% | 72,0% | 7,0% | 42,0% | 51,0% |
| N. | A | G | AA | AG | GG | |
| Marker enteriti (ENTERITI) | 938 | 2,0% | 98,0% | 0,0% | 4,0% | 96,0% |
| Marcatore | Capi | Alleli | Genotipi | |||
|---|---|---|---|---|---|---|
| N. | Q | WT | QWT | WTWT | ||
| VRTN | 366 | 52,5% | 47,5% | 31,1% | 42,6% | 26,2% |
| N. | G | A | GG | GA | AA | |
| IGF2 | 159 | 0,0% | 100,0% | 0,0% | 0,0% | 100,0% |
| N. | A | G | AA | AG | GG | |
| WUR10000125 (PRRS) | 448 | 73,0% | 27,0% | 55,0% | 37,0% | 8,0% |
| N. | A | G | AA | AG | GG | |
| Marker Metabolico (RESILIENZA) | 448 | 17,0% | 83,0% | 3,0% | 27,0% | 70,0% |
| N. | A | G | AA | AG | GG | |
| Marker 1 (BENESSERE) | 449 | 14,0% | 86,0% | 1,0% | 26,0% | 73,0% |
| N. | A | C | AA | AC | CC | |
| Marker 2 (BENESSERE) | 448 | 72,0% | 28,0% | 50,0% | 44,0% | 7,0% |
| N. | A | G | AA | AG | GG | |
| Marker 3 (BENESSERE) | 489 | 28,0% | 72,0% | 7,0% | 43,0% | 50,0% |
| N. | A | G | AA | AG | GG | |
| Marker enteriti (ENTERITI) | 448 | 2,0% | 98,0% | 0,0% | 4,0% | 96,0% |
Legenda:
- WUR associato alla resistenza alla PRRS. Allele favorevole G
- Marc. Metabolic. associato a funzioni metaboliche che determinano la resistenza/resilienza. Allele favorevole G
- Marker 1 associato a funzioni metaboliche che condizionano comportamento e benessere. Allele favorevole A
- Marker 2 associato a funzioni metaboliche che condizionano comportamento e benessere. Allele favorevole A
- Marker 3 associato a funzioni metaboliche che condizionano comportamento e benessere. Allele favorevole G
- Marker enteriti associato alla resistenza neonatale a Escherichia Coli Enterotossici (ETEC). Allele favorevole G
- VRTN (Vertnin) associato al numero di vertebre e mammelle. Allele favorevole Q
- IGF2 Insulin Growth Factor associato alle prestazioni produttive. Effetto inprinting paterno. Allele favorevole A
INBREEDING GENOMICO
| Capi | FROH | ROH N. | ROH (kb) Lunghezza | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| N. | Media | Media | d.s. | Min | Max | Media | d.s. | Min | Max |
| 21 | 0,259 | 99,69 | 10,8 | 69 | 132 | 6310,80 | 9401,10 | 1001,10 | 184678,74 |
Legenda:
- Consanguineità genomica stimata individuando regioni genomiche omozigoti, dette Runs Homozygosity (ROH). Il coefficiente di consanguineità genomico, FROH, si basa sulla percentuale del genoma autosomico di ROH in un animale (somma ROH>1000 kb). Gli animali sono stati genotipizzati con pannello SNPChip 70 K.